成都中医药大学国学院成立于2015年10月，是以中医药文化中心、古籍文献研究所、博物馆为主体，整合了校内其他院系关于国学的师资和课程资源，正式成立的，也正式形成了国学教学、科研、文化传播三位一体的院系结构。国学院的成立为开展国学教育和国学研究、促进中医药发展和创新搭建了新平台。现任院长邬建卫教授。

国学院的办院宗旨是：开展国学教育，培养和造就高素质医文兼通的中医药人才。开展国学研究，传承和创新中国传统学术和中医学术。开展文化建设，传承和弘扬中国传统文化和中医文化。